Para além do processamento de grandes conjuntos de dados experimentais associados a estruturas moleculares, são aplicações típicas da Químio-informática a utilização de métodos estatísticos e de aprendizagem automática para a previsão de atividades biológicas ou outras propriedades observáveis (QSAR/QSPR), a aplicação de métodos de inteligência artificial para elucidação estrutural a partir de dados espetroscópicos, a automação do planeamento de sínteses químicas, ou o desenvolvimento de estratégias para o arquivo e visualização de estruturas e informação química.

Publicações internacionais de referência. São revistas de referência nesta área o Journal of Chemical Information and Modeling (ACS), Molecular Informatics (Wiley), Journal of Computer-Aided Molecular Design (Springer) e mais recentemente o Journal of Cheminformatics (Chemistry Central).

Foram publicados em 2003 dois livros de texto que ajudaram a definir a disciplina de Químio-informática e que servem de material pedagógico em cursos de nível graduado e pós graduado:

• Chemoinformatics - a Textbook, Gasteiger, J. Engel, T., Eds.; Wiley-VCH: Weinheim, 2003.

• Leach, A. R.; Gillet, V. J. An Introduction to Chemoinformatics; Kluwer: Dordrecht, 2003.

Ensino da Químio-informática. Em 2006, na Declaração de Obernai ², 100 cientistas de 18 países europeus, E.U.A. e Canadá chamaram a atenção para a necessidade não só de treinar especialistas em Químio-informática como também de incorporar conteúdos desta disciplina na formação geral de químicos. O mercado de trabalho e os grupos académicos de investigação em Químio-informática recrutaram inicialmente químicos que trabalharam em áreas com forte envolvimento de computação – como os cálculos de química quântica ou a cristalografia de raios-X – ou que adquiriram formação específica de forma mais ou menos estruturada. Gradualmente, tem sido formalizado o ensino universitário da Químio-informática,³ por um lado através da criação de bacharelatos e mestrados que visam treinar especialistas para exercer funções químio-informáticas na indústria ou na academiaiv e, por outro, com a inclusão de disciplinas de Químio-informática em cursos de 1º e 2º ciclos de Química e de Farmácia.⁴